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注册公司是否会查询法定代表人的征信报告，取决于具体的情况和所在地的相关法规。

在注册公司时，工商部门主要审查的是股东的身份信息、认缴的出资额及比例等基本情况，并不会专门查询法定代表人的征信报告，如果公司出现失信情况，被列入经营异常名单或失信被执行人名单时，法人征信可能会受到影响，此时相关部门可能会查询法定代表人的征信情况，一些地方的市场监管也可能要求查看法定代表人的征信报告。

虽然注册公司不会直接查询法定代表人的征信报告，但如果公司有失信情况或处于特殊监管环境下，法定代表人的征信状况可能会受到审查，建议在注册公司前了解所在地的相关法规和政策，并保持良好的信用记录，如有更多疑问，可以咨询专业的法律人士获取帮助。